当用人单位以员工不胜任工作为由进行辞退时，赔偿问题需要遵循一定的法律程序和标准。以下是对这一问题的详细解答：
一、辞退程序
首先，用人单位需要证明员工确实不胜任工作。这通常需要有明确的考核标准、考核结果等证据来支撑。仅仅主观认为员工不胜任是不够的，必须有客观、可量化的证据。
其次，在证明员工不胜任工作后，用人单位不能直接辞退员工。根据《中华人民共和国劳动合同法》的规定，用人单位应当先对员工进行培训或者调整其工作岗位。这是为了给员工一个改进和适应的机会。
最后，如果经过培训或调岗后，员工仍然不能胜任工作，用人单位在提前30日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付1个月工资后，可以解除劳动合同。
二、赔偿标准
在解除劳动合同后，用人单位需要按照劳动者在本单位的工作年限支付经济补偿金。具体计算标准如下：
这里的月工资是指劳动者在劳动合同解除或者终止前十二个月的平均工资。例如，如果员工的月工资是5000元，且在单位工作了3年，那么用人单位应支付的经济补偿金为3个月工资，即15000元（不考虑额外支付的1个月工资作为通知替代的情况）。但若加上额外支付的1个月工资作为通知替代，则总赔偿为20000元（3年×5000元/年 + 5000元）。
三、特殊情况
未履行培训或调岗程序：如果用人单位未履行培训或调岗程序，直接以不胜任工作为由解除劳动合同，这种行为违反了法律规定。此时，用人单位需要按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
未提前通知或额外支付工资：如果用人单位没有提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后解除劳动合同，除了支付经济补偿金外，还可能需要额外支付这笔代通知金。
员工维权：如果员工对辞退决定有异议，认为用人单位的辞退行为违法或赔偿不合理，可以通过合法程序维权。这包括与公司协商、向劳动监察部门投诉、申请劳动仲裁以及向法院提起诉讼等途径。
四、建议
对于用人单位而言，在辞退不胜任工作的员工时，务必遵循法定程序，确保有充分的证据证明员工不胜任工作，并已经履行了培训或调岗等义务。同时，要合理计算并支付经济补偿金，以避免不必要的法律纠纷。
对于员工而言，如果认为自己被违法辞退或赔偿不合理，应当及时收集证据并寻求法律援助或咨询专业律师，以维护自己的合法权益。