核心结论：公司发工资却拿出另一家公司的合同，可能涉及多种法律关系及风险，需结合具体情况分析。以下是可能的情况及法律分析：

1. 关联公司代发工资（合法情形）

• 情形：若两家公司存在关联关系（如母子公司、兄弟公司），且通过书面协议约定由一方代发工资，可能属于合法操作。例如，集团内部统一由财务公司代发工资，但劳动合同仍与原公司签订。
• 法律要点：
  • 需有明确的代发协议或内部规定，证明工资发放主体与劳动关系主体分离的合法性。
  • 员工需确认劳动合同主体、社保缴纳主体与工资发放主体是否一致。若不一致，可能涉及社保权益受损（如社保未由实际用工单位缴纳）。
• 风险提示：若代发公司未实际履行用工义务（如未缴纳社保、未提供劳动条件），员工仍可向劳动合同签订方主张权利。

2. 劳务派遣或外包关系（需符合法定条件）

• 情形：若员工实际与A公司签订劳动合同，但被派遣至B公司工作，且工资由B公司发放，可能涉及劳务派遣。根据《劳动合同法》，劳务派遣需满足：
  • 派遣单位与用工单位签订劳务派遣协议；
  • 派遣岗位需符合临时性、辅助性或替代性要求；
  • 派遣单位与员工签订劳动合同，并承担用人单位义务（如支付工资、缴纳社保）。
• 法律要点：
  • 若未签订劳务派遣协议，或岗位不符合法定条件，可能被认定为“假外包、真派遣”，用工单位需承担连带责任。
  • 员工有权要求确认实际用工关系，并主张同工同酬等权利。

3. 规避法律责任（违法情形）

• 情形：若公司通过虚构合同关系（如让员工与空壳公司签约），意图逃避用工责任（如未缴社保、拖欠工资），可能涉嫌违法。
• 法律要点：
  • 根据《劳动合同法》，用人单位不得通过虚构劳动关系逃避法定义务。员工可主张与实际用工单位存在事实劳动关系，并要求补缴社保、支付经济补偿等。
  • 若涉及恶意串通损害员工权益，员工可向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

4. 合同主体与用工主体分离（需谨慎）

• 情形：若员工与A公司签订合同，但实际为B公司提供劳动，且无合法派遣或代发协议，可能涉及“挂靠”或“借名用工”。
• 法律要点：
  • 根据《关于确立劳动关系有关事项的通知》，劳动关系认定以“实际用工”为核心。员工可主张与B公司存在事实劳动关系，并要求B公司承担用工责任。
  • 若A公司未实际履行用人单位义务（如未支付工资），可能被认定为“空壳公司”，员工需追究实际用工方责任。

行动建议

1. 核查合同与实际用工情况：确认劳动合同签订方、工资发放方、社保缴纳方是否一致。
2. 保留证据：保存工资条、银行流水、工作证、考勤记录等证明实际用工关系的材料。
3. 主张权利：若发现公司违法操作，可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁，要求确认劳动关系、补缴社保、支付工资差额等。

提示：劳动关系认定需结合具体证据，建议根据实际情况进一步分析。如有疑问，可直接向我咨询具体法律问题。