机关单位自行制定劳动合同并不直接违法，但需满足法定条件与程序，否则可能构成违法。以下从不同角度为您详细分析：

1. 合法性前提：内容与程序均需合规

• 内容合法：劳动合同的条款必须符合《劳动合同法》及相关法律法规，不得包含歧视性、强制性或违反公序良俗的内容。例如，不能约定“员工必须放弃社保”“无条件服从加班”等违法条款。
• 程序合法：制定过程需遵循民主程序（如职工代表大会讨论、协商），并公示或告知劳动者。若机关单位未履行这些程序，即使条款合法，也可能因程序瑕疵被认定为无效。

2. 机关单位的特殊性：需区分劳动关系与行政关系

• 公务员与事业单位人员：若机关单位与劳动者建立的是行政关系（如公务员、事业单位编制人员），则不适用《劳动合同法》，而是适用《公务员法》或《事业单位人事管理条例》。此时，单位制定的“合同”可能属于内部管理文件，但需符合相关法规。
• 编外人员或劳务派遣：若机关单位与编外人员、劳务派遣人员建立的是劳动关系，则必须签订书面劳动合同，且条款需严格遵守《劳动合同法》。自行制定的合同若违反法律强制性规定（如未约定试用期、未缴纳社保），则构成违法。

3. 违法后果：合同无效或承担赔偿责任

• 合同无效：若劳动合同条款违反法律、行政法规强制性规定，或未履行法定程序，劳动者可主张合同无效，并要求单位承担相应责任。
• 赔偿责任：单位因违法制定合同导致劳动者损失的（如未支付加班费、未缴纳社保），需承担赔偿责任。劳动者还可向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。

4. 实务建议：如何合法制定劳动合同？

• 参考模板：使用当地人社部门发布的劳动合同示范文本，确保条款合规。
• 民主程序：涉及劳动者切身利益的条款（如工资、工时、休假），需通过职工代表大会或全体职工讨论协商。
• 公示告知：合同签订前需向劳动者公示或告知条款内容，确保其知情权。
• 定期审查：根据法律法规更新（如最低工资标准调整），及时修订合同条款。

5. 若已签订违法合同，如何维权？

• 协商解决：与单位沟通，要求修改或补充合法条款。
• 投诉举报：向当地劳动监察大队投诉，要求查处违法行为。
• 申请仲裁：若协商无果，可向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，主张合同无效或要求赔偿。

总结：机关单位自行制定劳动合同本身不违法，但必须确保内容合法、程序合规。若涉及劳动关系，需严格遵守《劳动合同法》；若涉及行政关系，则需符合《公务员法》等法规。如有疑问，可直接向我咨询，我会结合具体案情为您提供专业建议。