公司仅以加班时间离岗为由开除员工，一般是不合法的。以下从不同角度为您详细分析：

法律角度

根据我国《劳动法》的相关规定，加班是员工为了完成工作任务而额外付出的劳动力。用人单位不能仅凭员工加班期间离岗这一行为就随意开除员工。除非公司能够证明员工离岗行为严重违反了公司的规章制度，并且这种违反行为达到了可以解除劳动合同的程度，同时公司还需要持有确切的证据来支持其开除决定。

• 若公司无合理理由开除：如果公司没有合理的理由，仅仅因为员工加班时离岗就予以开除，那么这无疑构成违法解除劳动合同。根据《劳动合同法》的规定，被解雇的员工有权要求公司继续履行劳动合同义务，或者选择向公司索要赔偿金。赔偿金的标准通常按照员工在公司的工作年限和月工资来计算。

• 若公司有合理理由开除：如果员工确实因为严重违反公司规章制度（如长时间离岗导致工作严重延误或造成其他重大损失）而被开除，且公司持有确切证据，那么这种开除行为可能是合法的。但即便如此，公司也需要确保其开除决定符合法律法规和公司内部规章制度的规定。

实际操作角度

• 证据收集：为了确保自身权益得到有效维护，建议您在面临此类情况时，妥善整理相关证据，如加班详实纪录、解聘通知书、公司规章制度等。这些证据将有助于您在后续的法律程序中证明自己的权益。

• 法律程序：如果您认为公司的开除决定不合法，您可以选择向劳动仲裁机构申请劳动仲裁，或者向人民法院提起诉讼。在法律程序中，您需要提供充分的证据来支持自己的主张，并遵循法律程序的规定。

建议与后果

• 建议：在面临公司开除决定时，建议您首先与公司进行沟通协商，尝试解决问题。如果协商无果，您可以考虑寻求法律援助或咨询专业律师的意见。

• 后果：如果公司违法开除员工，除了需要支付赔偿金外，还可能面临劳动行政部门的处罚和声誉损失。而对于员工来说，违法开除可能导致其失去工作机会和收入来源，对其生活造成严重影响。

举例说明：假设某员工在加班期间因个人原因短暂离岗，但并未影响工作进度和结果。公司却以此为由开除该员工，且无法提供充分证据证明员工的离岗行为严重违反了公司规章制度。在这种情况下，公司的开除决定很可能是违法的，员工有权要求公司继续履行劳动合同或支付赔偿金。

综上所述，公司仅以加班时间离岗为由开除员工一般是不合法的。如果您面临此类情况，建议您妥善收集证据并寻求法律援助或咨询专业律师的意见。如果您还有其他关于劳动工伤方面的法律问题，也可以直接向我咨询。