针对您提出的“原公司被收购后纠纷怎么处理”的问题，这确实是一个涉及法律、商业和实际操作多个层面的复杂问题。以下是我为您整理的详细解答，希望能为您提供清晰的指导。

一、纠纷处理方式

1. 协商解决

   • 当原公司被收购后出现纠纷，首先建议双方尝试通过协商来解决。这包括收购方、原公司管理层以及可能的债权人或员工代表。协商过程中，应明确各自的诉求和立场，寻求共赢的解决方案。例如，可以调整支付安排、重新协商合同条款等。

2. 调解介入

   • 如果协商陷入僵局，可以考虑引入第三方调解机构或专业人士进行调解。这些机构或人士通常具有丰富的商业和法律经验，能够客观公正地分析问题，并提出合理的建议。调解过程相对灵活，且保密性强，有助于维护双方的公司声誉和商业关系。

3. 仲裁裁决

   • 如果收购协议中已经约定了仲裁条款，那么双方可以将争议提交给约定的仲裁机构进行裁决。仲裁具有专业性、高效性和终局性，由各领域的专家担任仲裁员，能够准确判断复杂的商业问题。仲裁程序相对简洁明了，裁决结果对双方均具有法律约束力。

4. 诉讼解决

   • 在没有仲裁约定或对仲裁结果不满意的情况下，双方可以通过向法院提起诉讼来解决纠纷。诉讼是最终的纠纷解决机制，具有强制执行力。但需要注意的是，诉讼程序相对复杂、耗时较长且成本较高。因此，在提起诉讼前，应充分评估证据收集情况、司法地方保护主义以及诉讼结果的不确定性等因素。

二、针对劳动仲裁的特殊处理

如果纠纷涉及劳动仲裁，即原公司与员工之间的劳动争议，那么处理方式会有所不同：

1. 原劳动合同继续有效

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》，用人单位发生合并或分立等情况，原劳动合同继续有效，由承继其权利和义务的用人单位继续履行。因此，原公司被收购后，收购方通常会承继原公司在劳动仲裁中的权利义务。

2. 新公司需参与仲裁

   • 仲裁程序应继续进行，新公司作为承继方需参与仲裁活动。新公司应积极收集证据，依据事实和法律进行答辩。

3. 新公司需履行裁决

   • 如果仲裁结果要求原公司承担责任，新公司需按裁决履行。若原公司恶意利用收购逃避劳动责任，劳动者可通过追加新公司为被申请人、证明资产转移等方式，要求新公司承担相应责任。

三、关键注意事项

1. 合同审查

   • 在处理收购纠纷时，首先应仔细审查收购协议的条款，明确双方的权利义务关系。这是解决纠纷的基础和前提。

2. 证据收集

   • 收集和整理与纠纷相关的各类证据至关重要，包括合同文本、往来邮件、会议纪要、财务报表等。这些证据将在纠纷解决过程中发挥关键作用。

3. 尽职调查

   • 在收购前，收购方应进行详细的尽职调查，全面了解目标公司的财务状况、法律状况及重要资产等信息。这有助于避免因信息不对称而引发的纠纷。

4. 法律咨询

   • 聘请专业律师提供法律咨询和代理服务是确保收购流程合法合规的重要保障。律师能够协助双方制定合理的收购策略，规避潜在风险，并在纠纷发生时提供专业的法律支持。

综上所述，原公司被收购后的纠纷处理方式多种多样，双方应根据具体情况选择最合适的解决方式。同时，在收购过程中应加强沟通和协商，注重合同审查和证据收集工作，并聘请专业律师提供全程法律服务，以确保收购活动的顺利进行并有效防范纠纷的发生。希望这些建议能对您有所帮助。