公司变更薪酬制度是否合法，关键在于其是否遵循了合法、合理、程序正当的原则，并与员工进行了充分的协商和沟通。若满足这些条件，则通常不违反法律规定；反之，则可能构成违法行为。以下是对此问题的详细分析：
合法合规的要求
遵守法律法规：新的薪酬制度必须严格遵守国家法律法规，特别是《中华人民共和国劳动法》和《中华人民共和国劳动合同法》等相关规定。例如，薪酬水平不得低于当地最低工资标准，工作时间和加班工资的计算也必须符合法律要求。
与员工协商一致：根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条，用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容，包括薪酬制度。因此，公司在更改薪酬制度前，应与员工进行充分协商，并取得大多数员工的同意。这可以通过召开职工大会、部门会议或逐一与员工沟通等方式实现。若公司未经员工同意擅自变更薪酬制度，则属于违法行为。
履行民主程序：对于设有工会或职工代表大会的公司，更改薪酬制度还需提交这些组织讨论，并听取其意见和建议。公司应尊重工会或职工代表的意见，与之平等协商确定最终的薪酬制度。若公司未履行必要的民主程序，就直接实施新的薪酬制度，这种程序上的瑕疵也可能被认定为违法。
违反法律规定的情形
若公司未满足上述合法合规的要求，则可能构成违法行为，具体表现如下：
擅自变更：公司在未与员工协商一致的情况下，单方面更改薪酬制度，降低员工工资待遇，违反了《中华人民共和国劳动合同法》关于劳动合同变更的规定。这种行为侵害了员工的合法权益，可能导致法律纠纷。
程序违法：公司未履行必要的民主程序，如未将薪酬制度的变更提交工会或职工代表大会讨论，就直接实施新的薪酬制度。
内容违法：新的薪酬制度内容本身违反法律法规的强制性规定，如超时工作不支付加班费、薪酬低于最低工资标准等。这些违法行为将直接损害员工的切身利益，并可能引发法律诉讼。
员工权益保护
如果员工认为公司更改薪酬制度的行为违法，他们可以通过多种途径来维护自己的合法权益：
协商：员工可以尝试与公司进行协商，寻求合理的解决方案。
投诉：若协商无果，员工可以向劳动监察部门投诉，请求其介入调查并处理。
仲裁或诉讼：员工还可以申请劳动仲裁或提起诉讼，通过法律手段来维护自己的权益。
特殊情形下的合法变更
当然，在一些特定情形下，公司更改薪酬制度可能被视为合理。比如员工不能胜任工作，公司经过培训或者调整工作岗位后，根据其新的工作表现和能力重新确定薪资；或者因企业经营困难等客观原因，与工会或全体职工说明情况、听取意见后进行合理降薪等。但即便如此，也需严格按照法律规定和程序进行。
总结来看，公司更改薪酬制度是否合法，取决于其是否遵循了合法、合理、程序正当的原则，并与员工进行了充分的协商和沟通。公司在更改薪酬制度时，应严格遵守相关法律法规，确保员工的合法权益得到充分保障。若您在此方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。