工作9小时休息1小时，在一般情况下是不合法的，但具体是否合法需根据工时制度来判断。以下从不同角度进行分析：
一、标准工时制下的情况
法律规定：
- 根据《中华人民共和国劳动法》第三十六条，国家实行劳动者每日工作时间不超过8小时、平均每周工作时间不超过44小时的工时制度。
合法性分析：
- 在标准工时制下，如果劳动者被安排每天工作9小时（即使包含1小时的休息时间，实际工作时间仍为9小时），这明显超过了法定的8小时工作制，因此通常是不合法的。
- 用人单位若需安排劳动者延长工作时间，必须按照法律规定支付加班工资，且加班时间需严格遵守法律限制。
二、特殊工时制下的情况
法律规定：
- 企业因生产特点不能实行标准工时制的，经劳动行政部门批准，可以实行其他工作和休息办法，如不定时工作制和综合计算工时工作制。
合法性分析：
- 不定时工作制：对于某些工作性质特殊、工作时间不固定的岗位，如企业高级管理人员、销售人员等，可以实行不定时工作制。在此制度下，不存在固定的每日工作时间限制，因此每天工作9小时（包含休息时间）可能是合法的。
- 综合计算工时工作制：此制度以周、月、季、年等为周期，综合计算工作时间。如果在某个特定周期内，虽然某些天工作时间超过8小时，但整个周期内平均日工作时间和周工作时间未超过法定标准，则每天工作9小时（包含休息时间）也可能是合法的。
三、特殊情况下的延长工作时间
法律规定：
- 根据《劳动法》第四十一条，用人单位因生产经营需要，经与工会和劳动者协商后可以延长工作时间，但一般每日不得超过1小时；因特殊原因需要延长工作时间的，在保障劳动者身体健康的条件下，延长工作时间每日不得超过3小时，且每月不得超过36小时。
合法性分析：
- 在特定条件下，经过合法程序协商，劳动者的工作时间可以超过8小时，但必须严格遵守上述限制条件。如果劳动合同中规定的上班时间为9小时（包含休息时间），且未经合法程序协商或超出延长工作时间的限制，则通常是不合法的。
四、劳动者权益保护建议
- 劳动者应了解自己的工作时间权利，并在发现工作时间超过法定标准时及时向用人单位提出异议。
- 若用人单位拒绝改正，劳动者有权向当地劳动监察部门投诉举报，以维护自己的合法权益。
总结：工作9小时休息1小时是否合法，需根据具体的工时制度来判断。在标准工时制下，这通常是不合法的；但在特殊工时制或经过合法程序协商的特殊情况下，可能是合法的。劳动者应充分了解自己的工作时间权利，并在必要时采取相应措施保护自己的合法权益。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。