经过第三方办理食品许可证是否违法，不能一概而论，需结合具体情况判断。以下从不同角度进行分析：

1. 若第三方具备合法资质且操作合规

• 不违法：如果第三方是依法设立的行政审批中介服务机构，且按照法定程序和要求代为办理食品许可证（如整理材料、提交申请等），此行为属于合法的委托代理范畴。根据《行政许可法》相关规定，申请人可以委托他人代为提出行政许可申请，但需提交授权委托书及双方身份证明。
• 关键点：第三方需具备相应资质（如市场监管部门备案的中介机构），且办理过程中未伪造、变造材料或采取其他欺诈手段。

2. 若第三方存在违法行为

• 违法情形：
  • 伪造材料：第三方通过伪造检验报告、场地证明等文件帮助申请人获取许可证，涉嫌违反《刑法》第二百八十条（伪造国家机关公文罪）及《食品安全法》第一百二十二条（未取得许可从事食品生产经营活动的处罚）。
  • 行贿受贿：若第三方与监管部门工作人员勾结，通过贿赂手段违规发证，可能构成行贿罪或受贿罪共犯。
  • 无资质经营：第三方未取得合法代理资格即从事代办业务，可能违反《市场主体登记管理条例》等规定，面临行政处罚。
• 法律后果：申请人若明知第三方违法仍委托办理，可能承担行政处罚（如罚款、吊销许可证）甚至刑事责任（如共同犯罪）。

3. 申请人的法律风险

• 尽职调查义务：申请人有义务审查第三方的合法性及资质。若因疏忽委托无资质机构导致违法，可能被认定为“过失违法”，仍需承担相应责任。
• 连带责任：根据《民法典》第一千一百六十九条，教唆、帮助他人实施侵权行为的，应与行为人承担连带责任。若第三方行为构成侵权（如因许可证违法导致消费者损害），申请人可能需共同赔偿。

4. 合规建议

• 核实第三方资质：要求第三方提供营业执照、行政审批中介服务备案证明等文件，并通过官方渠道（如市场监管局网站）查询其信誉。
• 全程参与办理：避免“全权委托”后不闻不问，应定期跟进办理进度，确保材料真实合法。
• 保留书面证据：签订委托合同时明确双方权利义务，特别是对违法行为的责任划分条款。

总结：通过第三方办理食品许可证本身不违法，但需确保第三方合法合规。若发现第三方存在伪造材料、行贿等行为，应立即终止合作并向监管部门举报。如有具体案例或证据，可进一步向我咨询，我将结合细节提供针对性法律意见。