若您申请法院调查公司工资发放表，而公司不配合，法院有权对公司采取相应的强制措施，并可能对公司处以罚款。以下从不同角度为您详细分析：
法院调查权与公司的配合义务
在劳动仲裁或诉讼过程中，若您需要证明与公司之间的工资发放情况，而公司拒绝提供工资发放表等关键证据，您可以向法院申请调查取证。根据《中华人民共和国民事诉讼法》的相关规定，法院有权向有关单位和个人调查取证，有关单位和个人不得拒绝。因此，公司有义务配合法院的调查工作，提供相关的工资发放表等证据材料。
公司不配合的法律后果
法院强制措施：
- 若公司拒绝配合法院的调查工作，法院有权对公司采取强制措施，如责令其履行义务、罚款等。这些措施旨在确保法院调查工作的顺利进行，维护法律的权威性和公正性。
罚款：
- 根据相关法律规定，单位或个人拒不履行人民法院已经发生法律效力的判决、裁定的，人民法院可以根据情节轻重予以罚款。罚款的金额会根据具体情况而定，但通常会对公司造成一定的经济压力。以您提到的案例为例，河南省高级人民法院曾对拒不协助查帐的单位处以二万元的罚款，这显示了法院对此类行为的严厉态度。
影响公司信誉：
- 公司不配合法院调查的行为还可能对其信誉造成负面影响。在商业活动中，信誉是企业的重要资产之一。若公司因不配合法院调查而被处罚或公开批评，可能会损害其在客户、合作伙伴和公众中的形象，进而影响其业务发展和市场竞争力。
您的应对策略
及时申请法院调查：
- 若您需要公司工资发放表等证据材料，而公司拒绝提供，您应及时向法院申请调查取证。在申请时，您应提供充分的理由和证据，说明为何需要这些材料以及它们对案件的重要性。
关注法院调查进展：
- 在法院调查过程中，您应关注调查的进展情况，并及时与法院沟通。若公司拒绝配合调查，您应向法院反映情况，并请求法院采取相应的强制措施。
准备后续法律程序：
- 若公司因不配合法院调查而受到处罚，您应准备后续的法律程序，如继续推进劳动仲裁或诉讼等。在此过程中，您应充分利用法院调查取得的证据材料，为自己的权益辩护。
温馨提示：在处理此类法律问题时，建议您保持冷静和理性，遵循法律程序和规定。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。