企业改提成制度员工不同意时，是否需要赔偿及赔偿方式需根据具体情况判断，具体分析如下：
一、企业单方面变更提成制度且员工不同意的法律后果
若企业单方面变更提成制度且未与员工协商一致：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第三十五条：“用人单位与劳动者协商一致，可以变更劳动合同约定的内容。变更劳动合同，应当采用书面形式。”若企业未与员工协商一致即单方面变更提成制度，该变更行为可能被认定为违法。
- 在此情况下，员工有权要求企业按照原提成制度履行合同，或主张企业因违法变更合同而承担相应责任。若企业因此解除与员工的劳动合同，且解除行为不符合法定情形，则可能构成违法解除，需支付赔偿金。
赔偿金的计算：
- 若企业违法解除劳动合同，根据《中华人民共和国劳动合同法》第八十七条：“用人单位违反本法规定解除或者终止劳动合同的，应当依照本法第四十七条规定的经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。”
- 经济补偿标准按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。因此，赔偿金为经济补偿标准的二倍。
二、企业与员工协商变更提成制度但未达成一致的后果
若企业与员工就提成制度的变更进行协商但未达成一致：
- 在此情况下，企业不得单方面强制变更提成制度。若企业因此解除与员工的劳动合同，需考虑解除行为的合法性。
- 若解除行为符合《中华人民共和国劳动合同法》第四十条规定的情形（如劳动者不能胜任工作，经过培训或者调整工作岗位，仍不能胜任工作的），则企业需支付经济补偿，而非赔偿金。
经济补偿的计算：
- 根据《中华人民共和国劳动合同法》第四十七条，经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
三、建议与风险提示
对于企业：
- 在变更提成制度前，应与员工进行充分协商，确保变更行为的合法性。
- 若需解除与员工的劳动合同，应确保解除行为符合法定情形，并依法支付经济补偿或赔偿金。
对于员工：
- 若企业单方面变更提成制度且未与自己协商一致，有权要求企业按照原提成制度履行合同。
- 若企业因此解除与自己的劳动合同，且解除行为不符合法定情形，有权主张企业支付赔偿金。
- 在处理此类纠纷时，建议保留相关证据（如劳动合同、提成制度变更通知、协商记录等），以便在必要时维护自己的合法权益。
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