结论前置：老板拖欠工资三个月，您发微信请假无回复，这并不影响您申请劳动仲裁，且仲裁通常是有效的。
详细分析：
仲裁的有效性：
- 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》，用人单位拖欠工资属于劳动争议范畴，劳动者有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 仲裁裁决具有法律效力，若劳动者仲裁获胜，用人单位需依照裁决支付拖欠工资。若用人单位拒不履行，劳动者可向法院申请强制执行。
请假无回复对仲裁的影响：
- 您发微信请假无回复，这并不影响您申请劳动仲裁的权利。请假与拖欠工资是两个独立的事实，仲裁委员会会依据您提供的证据和法律规定来判定用人单位是否拖欠工资。
- 重要的是，您需要保留好与用人单位存在劳动关系的证据（如劳动合同、工资条、考勤记录等）以及用人单位拖欠工资的证据（如银行转账记录、工资条等），以便在仲裁时提供。
仲裁前的准备：
- 在申请仲裁前，您可以尝试与用人单位进行沟通协商，要求其支付拖欠工资。若协商不成，再向劳动监察部门投诉或申请劳动仲裁。
- 准备仲裁材料时，确保所有证据都是真实、合法且有效的。这有助于提高仲裁的成功率。
仲裁后的执行：
- 若仲裁裁决用人单位需支付工资等款项，但用人单位拒不履行，您可向法院申请强制执行。法院会依法采取措施，迫使用人单位履行支付义务。
法律建议：
- 尽快收集并整理好与用人单位存在劳动关系的证据以及拖欠工资的证据。
- 在仲裁时效内（通常为一年）向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。
- 若对仲裁结果不服，可在规定时间内向法院提起诉讼。
可能后果：
- 若仲裁成功且用人单位履行裁决，您将获得应得的工资及可能的其他补偿（如赔偿金）。
- 若用人单位拒不执行仲裁结果，您可通过法院强制执行程序来保障权益实现。但请注意，强制执行程序可能需要一定的时间和成本。
总结：老板拖欠工资三个月，您发微信请假无回复，这并不影响您申请劳动仲裁的权利。仲裁通常是有效的，且若仲裁成功，您有权获得应得的工资及可能的其他补偿。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。