面对您在公司上班时被抓，且老板跑路的情况，这确实是一个复杂且棘手的问题。不过，别担心，我会一步步为您梳理可能的解决路径。
一、明确被抓原因及自身责任
首先，您需要明确自己被抓的具体原因。如果是因自身违法犯罪行为被抓，那么您需要按照司法程序接受处理。但如果是因老板的违法犯罪行为（如诈骗、非法经营等）导致您被牵连，那么情况就有所不同了。在确认自身无违法犯罪行为的前提下，您或您的家属应积极配合司法机关的调查，以尽快恢复自由。
二、处理欠薪等劳动权益问题
收集证据：
- 劳动合同、工资条、考勤记录、工作证等，这些都是证明您与公司存在劳动关系以及工资情况的重要证据。
向劳动监察部门投诉：
- 您可以向当地的劳动监察部门投诉，要求他们责令老板支付未支付的工资报酬及经济补偿。劳动监察部门有权对此类违法行为进行调查并作出处理。
申请劳动仲裁：
- 如果投诉无果，您可以在知道或应当知道权利受侵害之日起一年内，向劳动争议仲裁委员会申请仲裁。仲裁裁决生效后，如果老板不履行，您可以向法院申请强制执行其财产。
三、针对老板违法犯罪行为的应对措施
报案并配合调查：
- 如果老板的违法犯罪行为导致您被抓，您或您的家属应立即向公安机关报案，并积极配合调查。这有助于司法机关尽快查明事实真相，还您清白。
刑事附带民事诉讼：
- 在司法程序中，您还可以通过刑事附带民事诉讼的方式，向老板主张民事赔偿。这包括因老板违法犯罪行为给您造成的经济损失（如欠薪、精神损害等）。
四、关注老板财产线索及执行情况
- 即使通过仲裁或诉讼胜诉，如果老板名下无可供执行的财产，执行可能会遇到阻碍。因此，您需要密切关注老板的财产线索，如银行账户、房产、车辆等，并及时向法院或相关执行机构提供。
五、持续跟进权益争取
- 对于工资、社保等权益的争取，您需要持续跟进。即使老板跑路，也不能放弃自己的合法权益。通过合法途径维护自身权益，是减少损失、保障自身利益的关键。
六、法律咨询与援助
- 在整个过程中，如果您感到困惑或无助，可以寻求专业的法律咨询或援助。律师或法律援助机构可以为您提供专业的法律意见和帮助，确保您的权益得到最大程度的保障。
总之，面对老板跑路且自己被抓的复杂情况，您需要保持冷静、积极收集证据、通过合法途径维护自身权益。希望这些建议能对您有所帮助。如果您还有其他问题或需要进一步的帮助，请随时告诉我。