停工留薪期原则上应按照医疗机构最初出具的休息3个月来计算，但需结合复查结果及实际伤情恢复情况综合判定。具体分析如下：

1. 以首次诊断意见为主
   根据《工伤保险条例》第三十三条，停工留薪期一般根据医疗机构出具的病假证明确定。若出院时医生明确建议休息3个月，且该建议基于伤情诊断的合理性，则用人单位应以此为准。复查时“建议休息0天”可能反映伤情恢复良好，但若未达到临床治愈标准（如功能未完全恢复、存在潜在风险），首次诊断的休息期仍具有法律效力。

2. 复查结果的影响
   复查意见是动态调整的依据。若复查显示伤情已稳定、无需继续休息，用人单位可据此调整停工留薪期。但需注意：

   • 复查意见需由同一医疗机构或更高级别医院出具；
     
   • 若劳动者对复查结果有异议，可申请劳动能力鉴定委员会确认停工留薪期。

3. 争议解决路径
   若双方对停工留薪期存在争议，可按以下步骤处理：

   • 协商：劳动者与用人单位协商确定期限；
     
   • 鉴定：向设区的市级劳动能力鉴定委员会申请确认；
     
   • 仲裁/诉讼：对鉴定结果不服的，可申请劳动仲裁或提起诉讼。

建议：劳动者应保留出院诊断证明、复查报告等证据，若用人单位擅自缩短停工留薪期，可依法维权。如有进一步疑问，可直接向我咨询具体处理方案。