结论前置：针对您提出的“房子购买以后由于顶楼渗水造成损失但是过了质保期怎么起诉”的问题，核心在于明确责任主体、收集证据并依法提起诉讼。以下是从不同角度给出的详细解答。
一、明确责任主体
开发商责任：
- 通常情况下，房屋的防水工程质保期为5年（具体以购房合同约定为准）。若渗水问题发生在质保期内，开发商应承担维修责任。但您的情况是已过质保期，此时开发商的责任可能减轻或免除，除非能证明渗水是由于开发商的施工质量问题导致，且该问题在质保期内即已存在但未被发现或处理。
- 建议：查阅购房合同中的质保条款，确认质保期及开发商的责任范围。若怀疑渗水与开发商施工质量有关，可考虑申请专业机构进行鉴定。
物业公司责任：
- 若渗水问题是由于公共部位（如屋顶）的维护不当导致，且该部位属于物业公司管理范围，则物业公司可能需承担责任。
- 建议：检查与物业公司的服务合同，明确物业公司的维护职责。若确认是物业公司责任，可先与物业公司协商解决，协商不成再考虑诉讼。
邻居责任：
- 若渗水是由于楼上邻居的装修或使用不当导致，则邻居需承担责任。
- 建议：与邻居沟通，了解渗水原因。若确认是邻居责任，可要求邻居进行修复或赔偿。
二、收集证据
无论责任主体是谁，收集充分的证据都是起诉的关键。证据应包括：
- 渗水现场照片或视频：直观展示渗水情况。
- 损失评估报告：由专业机构出具，证明渗水造成的具体损失。
- 沟通记录：与开发商、物业公司或邻居的沟通记录，证明您已尝试协商解决。
- 鉴定报告：若怀疑渗水与施工质量有关，可申请专业机构进行鉴定，出具鉴定报告。
三、依法提起诉讼
确定被告：
- 根据责任主体确定被告，可能是开发商、物业公司或邻居。
撰写起诉状：
- 起诉状应明确原告、被告、诉讼请求（如要求赔偿损失、修复房屋等）、事实与理由（详细阐述渗水情况、责任主体及证据）等。
提交法院：
- 将起诉状及相关证据提交至有管辖权的法院（通常是房屋所在地法院）。
参与诉讼：
- 按照法院的通知参与诉讼，包括庭前准备、出庭应诉等。
四、注意事项
- 诉讼时效：注意诉讼时效的规定，一般民事纠纷的诉讼时效为3年，自知道或应当知道权利受到侵害之日起计算。
- 专业协助：考虑聘请专业律师协助处理，以提高诉讼效率和胜诉率。
总结：针对您的情况，建议首先明确责任主体，然后收集充分的证据，最后依法提起诉讼。在诉讼过程中，注意诉讼时效和聘请专业律师的协助。若您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。