针对您提出的“停薪留职自主创业阶段将证书注册在实际就职公司是否属于挂证”的问题，我们可以从以下几个方面进行详细分析：

首先，我们需要明确“挂证”的定义。根据建办市函〔2024〕283号文件的规定，注册单位与实际工作单位不一致，或者出租出借注册执业资格证书等行为，均被视为“挂证”违法违规行为。这是判断是否构成挂证行为的基本准则。

接下来，我们分析您的情况。您处于停薪留职自主创业阶段，但将证书注册在实际就职的公司。这里的关键在于“实际就职”与“注册单位”是否一致。如果您的证书注册在了您并未实际工作的公司，或者您实际工作的公司并非证书注册的公司，那么这就构成了注册单位与实际工作单位不一致的情况，从而可能被视为挂证行为。

然而，如果您的证书注册在了您实际就职的公司，即注册单位与实际工作单位一致，那么这种情况并不构成挂证行为。但需要注意的是，即使注册单位与实际工作单位一致，如果存在出租出借注册执业资格证书等行为，仍然可能被视为挂证。

此外，我们还需要参考建办市函〔2019〕92号文件的规定，该文件列举了六类原则上不认定为“挂证”行为的情形。但这些情形主要针对的是实际工作单位与注册单位一致，但社会保险缴纳单位与注册单位不一致的人员。在您的情况下，如果并未涉及社会保险缴纳单位与注册单位不一致的问题，那么这些情形可能并不直接适用。

综上所述，如果您在停薪留职自主创业阶段将证书注册在了您实际就职的公司，且不存在出租出借注册执业资格证书等行为，那么这种情况并不构成挂证行为。但为了确保合规性，建议您在操作前仔细咨询相关行业主管部门或专业律师的意见，以确保您的行为符合相关法律法规和政策要求。