结论是：在您被公司指控与两位收银课长及两位款员合伙偷盗，但您自认为被冤枉的情况下，是否能够单独不立案，取决于多种因素，不能一概而论。以下是从不同角度进行的分析：
一、立案的法律依据与标准
根据《中华人民共和国刑事诉讼法》的相关规定，公安机关对于报案、控告、举报和自首的材料，应当按照管辖范围，迅速进行审查，认为有犯罪事实需要追究刑事责任的时候，应当立案。这意味着，立案的关键在于是否存在犯罪事实以及是否需要追究刑事责任。
二、您个人情况对立案的影响
证据情况：
- 如果公司提供的证据仅能证明您与其他被指控人员有共同的行为或联系，但无法直接证明您参与了偷盗行为，那么您个人的立案情况可能会受到质疑。
- 反之，如果公司提供了确凿的证据证明您参与了偷盗，那么您个人被立案的可能性就会大大增加。
角色与行为：
- 如果您在事件中只是被牵连，并未实际参与偷盗行为，或者您的行为并不构成犯罪，那么您可以向公安机关提供相关证据，以证明自己的清白。
- 如果您确实参与了偷盗行为，但认为自己的行为情节轻微或存在其他从轻、减轻处罚的情形，这并不影响立案，但可能在后续的审判阶段影响您的量刑。
三、您应采取的措施
积极配合调查：
- 在公安机关进行调查时，您应积极配合，如实陈述事实，提供相关证据。
- 避免隐瞒或歪曲事实，以免加重自己的法律责任。
寻求法律帮助：
- 如果您认为自己被冤枉，或者对立案有异议，可以及时咨询专业律师（比如我），了解自己的法律权利和义务。
- 律师可以为您提供法律意见，帮助您制定应对策略，甚至在必要时代表您进行法律辩护。
关注案件进展：
- 在案件处理过程中，您应关注案件的进展情况，及时了解自己的法律地位和可能面临的法律后果。
- 如果发现案件处理存在不当之处，可以及时向相关部门提出申诉或控告。
四、可能的法律后果
- 如果您被立案并最终被认定有罪，您将面临相应的刑事处罚，包括但不限于罚款、拘役、有期徒刑等。
- 如果您被证明无罪或案件被撤销，您将不会受到刑事处罚，但可能需要承担一定的民事责任（如因被错误指控而造成的名誉损失等）。不过，这通常需要通过民事诉讼来解决。
最后建议：面对此类指控，保持冷静和理性至关重要。您有权维护自己的合法权益，也有义务配合相关部门的调查。如果您有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。