单位已经申报工伤但因主体错误撤销受理决定，申请期限应当重新计算。以下是具体的分析：
一. 申请期限的重新计算
- 原申请被撤销：根据描述，单位已经申报工伤，但因主体错误导致受理决定被撤销。这意味着原申请程序已经终止，没有产生有效的工伤认定结果。
- 重新申请的必要性：由于原申请被撤销，为了保障职工的合法权益，需要重新提交工伤认定申请。重新提交申请时，应确保申请主体正确，避免再次因主体错误导致申请被撤销。
- 申请期限的重新起算：根据《工伤保险条例》及相关法律法规，工伤认定申请有一定的时效限制。但在此情况下，由于原申请因主体错误被撤销，申请期限应当从重新提交申请之日起重新计算。
二. 法律依据
- 《工伤保险条例》第十七条：职工发生事故伤害或者按照职业病防治法规定被诊断、鉴定为职业病，所在单位应当自事故伤害发生之日或者被诊断、鉴定为职业病之日起30日内，向统筹地区社会保险行政部门提出工伤认定申请。遇有特殊情况，经报社会保险行政部门同意，申请时限可以适当延长。此条款说明了工伤认定的申请时限，但并未直接涉及因主体错误撤销受理决定后的申请期限问题。然而，从法律精神出发，原申请被撤销后，应允许职工重新申请，并重新计算申请期限。
- 法律原则：在法律实践中，当原行政行为因错误被撤销后，通常会给予当事人重新申请或救济的机会，并重新计算相关期限。这是为了保障当事人的合法权益，避免因行政机关的错误导致当事人失去救济途径。
综上所述，单位已经申报工伤但因主体错误撤销受理决定后，申请期限应当重新计算。建议职工在重新提交申请时，仔细核对申请主体和相关材料，确保申请的准确性和完整性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。