申请工伤主体错误，法院要求重新作出具体行政行为的时效计算，需根据不同情况来确定：

1. 若法院判决撤销原工伤认定并责令重新作出，时效从收到判决书之日起算
   根据《工伤保险条例》及《行政诉讼法》相关规定，若法院判决撤销原工伤认定决定并责令社会保险行政部门重新作出具体行政行为，社会保险行政部门应在收到法院判决书后，重新启动工伤认定程序。此时，时效计算通常从收到判决书之日起算，但需注意：

   • 重新认定的期限：社会保险行政部门应在合理期限内完成重新认定，一般不超过原认定程序的时间（如60日），但法律未明确规定具体时限，需结合行政效率原则判断。
     
   • 起诉期限的衔接：若用人单位或劳动者对重新作出的认定不服，可在收到决定书之日起6个月内直接向法院提起行政诉讼（依据《行政诉讼法》第46条），而非先申请复议。

2. 若法院仅指出主体错误但未明确责令重作，需主动纠正并重新启动程序
   若法院判决指出原工伤认定主体错误（如应由A公司认定却误为B公司），但未明确责令重新作出，社会保险行政部门应主动撤销原认定并重新调查。此时：

   • 时效中断：原认定程序因主体错误而无效，重新认定需从纠正主体后重新计算时间。
     
   • 合理期限要求：虽无明确法律条文规定重新认定的具体时限，但行政机关应在“合理期限”内完成（实践中通常为1-2个月），避免程序拖延。

3. 关键风险提示：逾期未重作可能构成程序违法
   若社会保险行政部门在收到法院判决后，未在合理期限内重新作出认定，可能被认定为“未履行法定职责”，劳动者或用人单位可再次起诉，要求法院确认行政不作为违法并责令限期重作。

行动建议：

• 若您是劳动者，收到法院判决后应督促社会保险行政部门尽快重作认定，并保留送达回执等证据；
  
• 若您是用人单位，需关注重作程序是否合法（如是否重新调查、是否通知举证），避免程序瑕疵影响结果。
  

如有进一步细节（如法院判决原文、原认定主体错误的具体情形），可提供更多信息以便更精准分析。