在一般情况下，公司不能仅因孕妇长时间请假就将其开除。孕妇在怀孕期间享有特殊的劳动保护，这是由《中华人民共和国劳动法》、《中华人民共和国劳动合同法》以及《女职工劳动保护特别规定》等法律法规所明确规定的。

详细分析如下：

1. 法律依据：

   • 《中华人民共和国劳动合同法》第四十二条明确规定，女职工在孕期、产期、哺乳期内，用人单位不得依照本法第四十条（不能胜任工作）、第四十一条（经济性裁员）的规定解除劳动合同。
   • 《女职工劳动保护特别规定》第五条也强调，用人单位不得因女职工怀孕、生育、哺乳而降低其工资、予以辞退或与其解除劳动合同。

2. 合法与违法辞退的界限：

   • 合法辞退的情况：孕妇若严重违反用人单位的规章制度，如未经批准擅自延长假期或提供虚假的医疗证明等，或者严重失职、营私舞弊，给用人单位造成重大损害，用人单位有权解除合同。
   • 违法辞退的情况：若孕妇的请假行为符合法律法规规定，且没有严重违反公司规章制度或给用人单位造成重大损害，公司仅因孕妇长时间请假就将其开除，则属于违法行为。此时，孕妇有权要求用人单位继续履行劳动合同，或按照经济补偿标准的二倍支付赔偿金。

3. 公司的责任与义务：

   • 公司应承担为孕妇提供适合的工作环境、调整工作内容以适应其身体状况、保证休息时间等责任和义务。
   • 在孕妇长时间请假的情况下，公司应首先尝试通过沟通、提醒、调整工作岗位或制定合理的请假和工作安排等措施来解决问题，而非直接辞退。

综上所述，公司不能仅因孕妇长时间请假就将其开除。除非孕妇存在严重违反公司规章制度或给用人单位造成重大损害等特定情形，否则公司辞退孕妇将可能构成违法行为。我建议公司应充分理解并支持孕妇的请假需求，合理安排工作与请假时间，以促进劳动关系的和谐稳定。如有进一步需要，您可以继续咨询我。