跟子公司签劳动合同，工资由母公司发放在法律上并非绝对禁止，但存在需要特别注意的法律风险和合规要求。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 法律关系与法人独立性：

   • 子公司与母公司在法律上是相互独立的法人主体，各自承担法律责任。子公司具有独立的法人资格，能够依法独立承担民事责任，包括进行工资支付等日常经营活动。
   • 劳动者与子公司签订劳动合同，表明其人事关系隶属于子公司。工资发放情况是认定劳动关系的重要参考因素之一，但并不改变劳动合同的基本关系。

2. 明确约定与合法授权：

   • 若要实现由母公司发放子公司员工的工资，必须在劳动合同或补充协议中明确约定这一安排，包括支付标准、周期、方式等，以确保责任清晰，避免纠纷。
   • 这种安排需要得到各方的协商一致，并符合相关法律法规的规定，以确保其合法性。

3. 潜在风险与责任界定：

   • 母公司作为非劳动合同的签订主体，若擅自发放子公司员工的工资，可能引发劳动纠纷及法律责任问题。
   • 子公司作为劳动合同的签订主体，需承担用人单位的主要法律责任，包括但不限于工资支付的最终责任。若母公司代发工资，需明确在子公司无法按时足额发放工资时，母公司的法律责任承担方式。

4. 财务税务合规：

   • 子公司在发放工资时，应遵循相关财务制度和税法规定，如准确计算并代扣个人所得税，按时申报缴纳。
   • 若由母公司代发工资，同样需要确保财务税务的合规性，避免税务风险。

5. 劳动者权益保障：

   • 在复杂的主体关系下，应特别注意保护劳动者的知情权、维权途径等。劳动者有权了解并同意这种薪酬支付方式。
   • 应确保劳动者的合法权益不受损害，包括工资按时足额发放、社会保险依法缴纳等。

针对性建议：

• 在实施这种薪酬支付方式前，建议进行充分的法律评估和风险审查，确保符合相关法律法规的要求。
• 建立健全的财务管理制度，确保工资发放的记录清晰、准确，以便在需要时能够证明工资发放的实际情况。
• 加强与员工沟通，确保员工充分了解并同意这种薪酬支付方式，同时保障员工的合法权益不受损害。

综上所述，跟子公司签劳动合同但由母公司发工资在法律上虽可行，但需谨慎操作，确保符合相关法律法规的要求，并采取有效措施防范潜在的法律风险。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。