可以申请法院调查用人公司分类账。针对工程工资纠纷超过15年的情况，以下是对此问题的详细分析：

一. 诉讼时效与起诉权利

• 根据《中华人民共和国民法典》第一百八十八条的规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。但这并不意味着超过三年后就无法起诉，只是超过诉讼时效期间后，义务人可以提出不履行义务的抗辩，除非其自愿履行。
• 同时，《中华人民共和国民法典》还规定，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院才不予保护。因此，在拖欠工程款或工资纠纷超过15年但未满二十年的情况下，仍然有权向人民法院提起诉讼。

二. 法院调查取证权

• 根据《中华人民共和国民事诉讼法》第六十七条的规定，当事人及其诉讼代理人因客观原因不能自行收集的证据，或者人民法院认为审理案件需要的证据，人民法院应当调查收集。企业工资表或分类账作为证据的一种，如果人民法院认为审理案件需要，是可以依法进行调取的。
• 在劳动诉讼或相关纠纷中，如果公司账户流水或分类账是证明案件事实的关键证据，原告或代理律师可以申请法院进行调取。申请流程通常包括向法院提出书面申请，说明调取理由和目的，法院审查申请的合理性与合法性后，如认为必要，会向公司或相关金融机构发出调取证据的通知或命令。

三. 注意事项

• 申请调取公司账户流水或分类账必须基于合法的诉讼目的，且不能侵犯他人的合法权益。
• 调取的证据必须在法庭上进行质证和认证，确保其真实性和合法性。

综上所述，工程工资纠纷超过15年仍然可以申请法院调查用人公司分类账，但需注意诉讼时效的限制及法院调查取证的法定程序。如有进一步需要，您可以继续咨询我。