员工离职后，公司仍然可以追究其在职期间虚开发票的责任。以下是从不同角度对这一问题的详细分析：

1. 法律时效性：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条的规定，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。对于员工在职期间虚开发票的行为，如果公司在一年内发现并决定追究责任，那么是可以向劳动争议仲裁委员会申请仲裁的。
   • 需要注意的是，这里的时效是指从公司知道或应当知道权利被侵害之日起计算，而不是从员工离职之日起计算。因此，即使员工已经离职，只要公司在时效期内发现并决定追究，仍然可以提出仲裁申请。

2. 责任追究的依据：

   • 员工在职期间虚开发票，属于违反公司财务制度、可能构成违法甚至犯罪的行为。公司有权根据内部规章制度或相关法律法规，对员工进行责任追究。
   • 责任追究的方式可能包括但不限于：要求员工赔偿因虚开发票给公司造成的损失、解除劳动合同（如果虚开发票行为严重违反公司规章制度）、向相关部门举报（如果虚开发票行为构成犯罪）等。

3. 实际操作中的考虑：

   • 在实际操作中，公司需要权衡追究责任的利弊。一方面，追究责任可以维护公司的合法权益和财务制度；另一方面，也可能引发与员工的纠纷，甚至影响公司的声誉和员工关系。
   • 因此，公司在决定是否追究责任时，应综合考虑虚开发票行为的性质、严重程度、对公司的影响以及追究责任的成本和效果等因素。

4. 法律后果：

   • 如果员工虚开发票的行为构成犯罪（如虚开增值税专用发票罪），那么除了可能面临公司的责任追究外，还可能受到刑事处罚。
   • 即使不构成犯罪，员工也可能因违反公司规章制度而受到纪律处分或解除劳动合同等后果。

综上所述，员工离职后，公司仍然可以追究其在职期间虚开发票的责任。但具体是否追究以及如何追究，需要根据实际情况和法律法规进行综合考虑和决策。如果您有关于此类问题的进一步疑问或需要具体的法律建议，请随时向我咨询。