针对您提出的关于劳动仲裁申请中年休假工资、加班工资、经济补偿金等哪些仲裁申请可以超过仲裁时效的问题，以下是我的详细解答：

1. 关于仲裁时效的一般规定：

   • 根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》第二十七条，劳动争议申请仲裁的时效期间为一年。仲裁时效期间从当事人知道或者应当知道其权利被侵害之日起计算。

2. 年休假工资的仲裁时效：

   • 年休假工资属于劳动报酬的一部分，但根据司法实践，对于未休年休假工资报酬的仲裁时效，各地法院可能存在不同的理解。一种观点认为，年休假工资报酬属于福利待遇，适用一年的仲裁时效；另一种观点则认为，年休假工资报酬属于劳动报酬，应适用特殊仲裁时效（即劳动关系存续期间不受一年仲裁时效的限制，劳动关系终止后一年内提出）。但具体适用哪种时效，还需根据当地法院的判决和司法解释来确定。不过，从保护劳动者权益的角度出发，建议劳动者在知道或应当知道权利被侵害后尽快申请仲裁。

3. 加班工资的仲裁时效：

   • 加班工资同样属于劳动报酬的一部分。根据《中华人民共和国劳动争议调解仲裁法》及相关司法解释，对于拖欠劳动报酬的争议，劳动者在劳动关系终止后一年内提出仲裁申请的，不受一年仲裁时效期间的限制。但如果在劳动关系存续期间，劳动者知道或应当知道加班工资被拖欠，也应在合理期限内（一般不超过一年）提出仲裁申请，以避免因超过时效而丧失胜诉权。

4. 经济补偿金的仲裁时效：

   • 经济补偿金是在劳动合同解除或终止时，用人单位依法应支付给劳动者的补偿。对于经济补偿金的仲裁时效，一般也适用一年的规定。但需要注意的是，如果用人单位在解除或终止劳动合同时未依法支付经济补偿金，劳动者在知道或应当知道权利被侵害后一年内提出仲裁申请的，是有效的。

5. 特殊情况下的仲裁时效延长：

   • 在某些特殊情况下，如因不可抗力或其他正当理由导致劳动者无法在一年内提出仲裁申请的，仲裁时效可以中止或延长。但这种情况需要劳动者提供充分的证据来证明。

总结与建议：

• 对于年休假工资、加班工资和经济补偿金等劳动争议事项，劳动者在知道或应当知道权利被侵害后，应尽快在一年内提出仲裁申请，以避免因超过时效而丧失胜诉权。
• 如果劳动者在劳动关系存续期间发现权利被侵害，也应及时与用人单位沟通协商，或寻求法律援助，以维护自己的合法权益。
• 如有任何劳动纠纷方面的法律问题，欢迎直接向我咨询，我将为您提供专业的法律建议和帮助。