员工残疾不能工作，确实可以与单位签书面协议保留劳动关系，但具体情况需根据伤残等级和相关法律规定来确定。以下是从不同角度的分析：

1. 因工致残的情况：

   • 如果员工因工致残，并被鉴定为一级至四级伤残，根据法律规定，应保留劳动关系，员工退出工作岗位，单位不能解除劳动合同。此时，单位需按月支付伤残津贴，标准为一级伤残为本人工资的90%，二级伤残为本人工资的85%，三级伤残为本人工资的80%，四级伤残为本人工资的75%。
   • 若员工因工致残被鉴定为五级、六级伤残，同样保留与用人单位的劳动关系，由用人单位安排适当工作。难以安排工作的，由用人单位按月发给伤残津贴，五级伤残为本人工资的70%，六级伤残为本人工资的60%，并由用人单位按照规定为其缴纳应缴纳的各项社会保险费。经工伤职工本人提出，该职工可以与用人单位解除或者终止劳动关系，由工伤保险基金支付一次性工伤医疗补助金，由用人单位支付一次性伤残就业补助金。

2. 非因工致残的情况：

   • 如果员工非因工致残，在规定的医疗期满后不能从事原工作，也不能从事由用人单位另行安排的工作的，单位可以提前三十日以书面形式通知劳动者本人或者额外支付劳动者一个月工资后，解除劳动合同，但需支付经济补偿。然而，这并不意味着不能与单位签书面协议保留劳动关系，只是单位在特定条件下有权解除劳动合同。如果双方愿意，仍然可以协商签订书面协议保留劳动关系。

法律建议：

• 对于因工致残的员工，建议详细了解自己的伤残等级和相应的法律权益，与单位进行充分沟通，确保自己的合法权益得到保障。
• 对于非因工致残的员工，虽然单位在特定条件下有权解除劳动合同，但双方仍然可以协商签订书面协议保留劳动关系。此时，员工应了解自己的医疗期、工作能力恢复情况以及单位的相关政策，以便做出明智的决策。
• 在任何情况下，员工都应保留好能证明劳动关系的相关证据，如工资支付凭证、工作证、考勤记录等，以便在需要时维护自己的合法权益。

可能的法律后果：

• 如果单位违反法律规定解除劳动合同，员工有权要求单位支付赔偿金或继续履行劳动合同。
• 如果员工与单位签订书面协议保留劳动关系，但单位未按照协议履行义务，员工同样有权要求单位承担相应的法律责任。

总之，员工残疾不能工作时，是否可以与单位签书面协议保留劳动关系，需根据具体情况和相关法律规定来确定。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。