针对您提出的“总代理不让开店，公司允许开店怎么办”的问题，我们可以从以下几个方面来分析和解答：
核心结论：
- 查看代理协议：首先，您需要仔细查阅与总代理之间签订的代理协议，特别是关于代理权限、区域限制、开店权限等条款。
- 判断代理权限：根据代理协议的内容，判断您是否拥有在特定区域开店的独家代理权。
- 采取相应措施：若总代理的行为违反了代理协议，您可以书面通知总代理停止侵权行为，并考虑通过法律途径维护自己的权益；若协议未明确独家代理，则需进一步与公司沟通，明确开店权限。
详细分析：
查看代理协议：
- 代理协议是您与总代理之间合作的基础，也是解决争议的关键。
- 仔细阅读协议中的每一项条款，特别是与开店权限、代理区域、违约责任等相关的内容。
判断代理权限：
- 如果代理协议中明确规定您拥有在特定区域的独家代理权，那么总代理不允许您在该区域开店的行为就构成了违约。
- 如果协议中未明确独家代理权，或者您的开店请求超出了协议规定的范围，那么总代理的拒绝可能是合理的。
采取相应措施：
- 若总代理违约：您可以书面通知总代理，指出其违约行为，并要求其立即停止侵权。如果总代理拒绝改正，您可以考虑向法院提起诉讼，要求总代理承担违约责任，并赔偿因此造成的经济损失。
- 若协议未明确独家代理：您需要与公司进行进一步沟通，明确您在特定区域的开店权限。可以提出您的开店计划，并询问公司是否同意。如果公司同意，您可以要求公司出具书面证明，以便与总代理进行协商。
温馨提示：
- 在处理此类争议时，保持冷静和理性至关重要。避免采取过激行为，以免加剧矛盾。
- 如果您在法律方面有任何疑问或需要进一步的帮助，请随时向我咨询。我作为专业律师，将竭诚为您提供法律服务。