首先，工作人员独吞运费的行为可能构成职务侵占或盗窃等违法行为，应依法进行处理。具体来说：

1. 调查与取证：

   • 首先，需要对事件进行详细调查，包括运费的来源、金额、支付方式以及工作人员的职责等。
   • 收集相关证据，如交易记录、监控录像、证人证言等，以证明工作人员的独吞行为。

2. 法律评估：

   • 根据调查情况，评估工作人员的行为是否构成职务侵占、盗窃或其他违法行为。
   • 职务侵占通常指工作人员利用职务上的便利，将本单位财物非法占为己有；盗窃则是以非法占有为目的，秘密窃取他人财物的行为。

3. 处理措施：

   • 如果构成职务侵占或盗窃等违法行为，应依法向公安机关报案，由公安机关进行立案侦查。
   • 在公司内部，也可以依据公司规章制度对工作人员进行相应处理，如解除劳动合同、追回损失等。
   • 同时，公司应加强内部管理，完善财务制度，防止类似事件再次发生。

4. 预防措施：

   • 建立健全的财务管理制度，明确运费的支付流程和责任人。
   • 加强对工作人员的法律教育和职业道德培训，提高其法律意识和职业素养。
   • 定期对财务进行审计和检查，及时发现并纠正问题。

综上所述，处理工作人员独吞运费的问题需要综合考虑法律、公司规章制度以及预防措施等多个方面。如果你在此过程中遇到任何法律问题或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。