业务员挪用公司运费属于职务侵占行为，公司应依法采取相应措施维护自身权益。

1. 收集证据：

   • 公司应首先找到能证明运费被挪用的关键证据，如运费支付记录、业务员经手运费的凭证、公司财务账目等。
   • 定期进行公司财务审计和盘点，将盘点差异记录下来，这些都能作为有力证明。

2. 与业务员沟通：

   • 带着收集好的证据与业务员进行沟通，让其对挪用运费的情况作出说明，并要求归还运费或者赔偿相应损失。
   • 若业务员配合，可协商解决方案；若不配合，则进入下一步法律程序。

3. 向公安机关报案：

   • 若业务员不配合或拒绝归还运费，公司可向当地公安机关报案，由公安机关进行侦查。
   • 在报案时，需提供充分的证据材料，以协助公安机关立案和侦查。

4. 法律诉讼：

   • 在公安机关立案并侦查后，公司可通过刑事诉讼程序追究业务员的刑事责任。
   • 同时，公司可在刑事诉讼中附带提起民事诉讼，要求业务员返还运费或赔偿经济损失。

5. 法律依据：

   • 根据《刑法》相关规定，职务侵占数额较大，处三年以下有期徒刑或拘役，并处罚金；数额巨大，处三年以上十年以下有期徒刑，并处罚金；数额特别巨大，处十年以上有期徒刑或无期徒刑，并处罚金。

6. 后续管理：

   • 公司应加强内部财务管理和监督，防止类似事件再次发生。
   • 对业务员进行法律教育和职业道德培训，提高其法律意识和职业素养。

综上所述，业务员挪用公司运费属于职务侵占行为，公司应依法采取收集证据、与业务员沟通、向公安机关报案、法律诉讼等措施来维护自身权益。同时，公司也应加强内部管理和监督，防止类似事件的再次发生。