针对您提出的“团伙案件追诉期内立案了，部分成员被认定为嫌疑人时已经过了追诉期怎么处理”的问题，以下是我为您提供的详细解答：

首先，我们需要明确“追诉时效”的含义。追诉时效是刑法规定的一个有效期限，用于追究犯罪分子的刑事责任。一旦超过这个期限，司法机关就不能再对犯罪分子进行刑事追诉。

在团伙犯罪案件中，如果部分成员在立案时已经过了追诉时效，那么按照刑法的规定，这部分成员将不再被追究刑事责任。他们不会参与后续的刑事诉讼流程，也就是说，他们不会因为该团伙犯罪而受到法律的制裁。

然而，这并不意味着整个团伙案件的处理就此结束。对于其他未被追诉时效所限的成员，如果他们犯罪事实清楚、证据充分，司法机关仍然会依法对他们进行侦查、起诉和审判。这部分成员将需要承担他们应有的法律责任。

同时，已过追诉时效的成员虽然不再被追究刑事责任，但他们的存在和行为仍然可能对整个团伙犯罪案件产生影响。例如，他们的行为可能会作为认定整个团伙犯罪情节、危害后果等方面的参考因素，进而影响到对其他成员的量刑。

在处理这类案件时，司法机关会严格依据法律规定，结合案件的实际情况，准确认定每个成员的责任以及追诉时效的情况。这样做是为了确保法律能够得到正确实施，让犯罪行为得到应有的惩处，同时也保护了那些因追诉时效已过而不再被追究刑事责任的成员的合法权益。

综上所述，对于团伙案件中部分成员已过追诉时效的情况，司法机关会依法处理，既追究了应负刑事责任的成员，又保护了已过追诉时效成员的合法权益，同时确保了整个案件处理的公正性和合法性。