若案件已过追诉期公安机关仍立案，可分以下情况处理：

1. 追诉期已过且无特殊情形
   根据《刑法》第八十七条，法定最高刑为不满五年有期徒刑的，追诉期为五年；最高刑为五年以上不满十年有期徒刑的，追诉期为十年；最高刑为十年以上有期徒刑的，追诉期为十五年；最高刑为无期徒刑、死刑的，追诉期为二十年。若案件已超过上述期限，且不存在《刑法》第八十八条规定的“立案侦查或法院受理案件后逃避侦查或审判”或“被害人在追诉期内提出控告，公安机关应立案而未立案”等特殊情形，则追诉期已届满，公安机关的立案行为可能存在程序瑕疵。
   处理建议：
   

• 犯罪嫌疑人或其辩护人可向公安机关提出书面异议，要求撤销案件，并附上追诉期计算依据及相关证据（如判决书、案发时间证明等）；
  
• 若公安机关拒绝撤销，可向同级人民检察院申请立案监督，由检察院审查是否符合立案条件；
  
• 若案件已进入审查起诉阶段，可向检察院提出追诉期已过的抗辩，检察院应依法作出不起诉决定。

1. 追诉期虽过但存在特殊情形
   若案件符合《刑法》第八十八条规定的特殊情形（如立案后逃避侦查、被害人控告后未立案），则追诉期不受限制，公安机关立案合法。
   处理建议：
   

• 犯罪嫌疑人应积极配合调查，但可主张从轻或减轻处罚（如自首、立功、认罪认罚等）；
  
• 若认为公安机关认定特殊情形存在错误（如未逃避侦查、被害人未控告等），可收集反证（如居住证明、无逃避行为记录等）提交公安机关或检察院，申请撤销案件或不起诉。

1. 追诉期计算存在争议
   若对追诉期的起算点（如连续犯罪、持续状态犯罪的起算时间）或期限（如数罪并罚时的追诉期）存在争议，需结合具体案情分析。
   处理建议：
   

• 委托律师梳理案发时间、犯罪形态、量刑幅度等关键事实，准确计算追诉期；
  
• 若公安机关立案依据的计算方式有误，可通过法律意见书或听证会等形式提出异议，推动案件撤销或终止侦查。

总结：追诉期是刑事案件的重要程序性防线，若案件已过追诉期且无特殊情形，公安机关立案可能违法，可通过异议、监督等程序纠正；若存在特殊情形或计算争议，需结合案情具体分析。如有疑问，可直接向我咨询具体案件细节。