雇主抗辩不清楚雇员如何受伤，不能免赔。具体分析如下：

在劳动工伤案件中，雇主对于雇员在工作时间和工作场所内因工作原因受到的伤害，通常负有赔偿责任。雇主抗辩不清楚雇员如何受伤，并不能成为其免赔的合法理由。

1. 工伤认定的原则：

   • 工伤认定遵循“无过错责任”原则，即只要雇员在工作时间和工作场所内，因工作原因受到伤害，无论雇主是否有过错，都应承担赔偿责任。
   • 工伤认定并不要求雇主必须清楚雇员的具体受伤过程，而是基于雇员受伤的事实和与工作相关的因果关系进行认定。

2. 雇主的举证责任：

   • 在工伤赔偿纠纷中，雇主如果主张免赔，需要承担举证责任，证明雇员的受伤不属于工伤范畴，或者存在其他免赔事由。
   • 仅仅抗辩不清楚雇员如何受伤，并不能满足免赔的举证要求。

3. 法律后果：

   • 如果雇主无法提供有效证据支持其免赔主张，那么根据工伤赔偿的相关规定，雇主将需要承担雇员的工伤赔偿责任。
   • 这包括支付雇员的医疗费用、康复费用、停工留薪期间的工资福利等，以及可能的伤残赔偿金、一次性工伤医疗补助金等。

综上所述，雇主抗辩不清楚雇员如何受伤，并不能成为其免赔的合法理由。在工伤赔偿纠纷中，雇主应依法承担举证责任，并基于工伤认定的原则进行赔偿。如果雇主对工伤认定或赔偿事宜有疑问，建议咨询专业律师或相关机构以获取更准确的法律意见。