不愿意去新公司上班，通常不算自动离职。下面我将对此进行详细解释：

法律解释

依据《劳动合同法》，工作岗位是劳动合同的重要内容，变更岗位应遵循协商一致的原则。若公司未与员工协商就擅自调岗，员工有权拒绝。在这种情况下，员工不前往新岗位，不能认定为自动离职。

特殊情况

存在特殊情况，即如果劳动合同里明确约定公司有权根据经营需求合理调岗，且新岗位和原岗位有一定关联，薪资待遇没有明显降低，工作地点变动也在合理范围内，而员工没有正当理由却拒不服从调岗安排，公司按照规章制度处理时，可能会认定员工严重违纪，从而解除劳动合同。

法律建议

1. 协商：当员工遇到调岗纠纷时，首先可尝试与公司进行协商，表达自己的意见和诉求。
2. 法律维权：若协商无法达成一致，员工可以申请劳动仲裁来维护自身权益。在申请劳动仲裁时，员工应准备好相关证据，如劳动合同、调岗通知、薪资单等，以证明公司的调岗行为存在不当之处。

综上所述，不愿意去新公司上班通常不算自动离职，但具体还需根据劳动合同的具体内容和公司的规章制度来判断。如遇纠纷，建议先与公司协商，协商不成再申请劳动仲裁。