便利店商品过期罚店员不合法。

一. 分析过期商品责任归属

1. 店员职责与过错：虽然店员有责任检查商品保质期并确保货架上的商品未过期，但过期商品的出现并不完全等同于店员疏于职守。商品过期可能由多种因素导致，如供应链问题、库存管理系统失误等。
2. 企业责任：根据《中华人民共和国食品安全法》第四条，食品生产经营者对其生产经营食品的安全负责。便利店作为食品经营者，应当建立并完善安全操作规程和相应制度，确保商品在保质期内销售。因此，商品过期的风险应当由企业自行承担，而非转嫁给店员。

二. 法律依据与处罚合理性

1. 法律依据：如上所述，《中华人民共和国食品安全法》明确规定了食品生产经营者的责任，便利店不能强行要求店员为过期产品承担经济赔偿责任。
2. 处罚合理性：便利店可以依据内部规章制度对店员进行处罚，但这种处罚应当合理且符合法律法规。让店员承担过期商品的经济责任显然是不合理的，也违反了相关法律法规。

三. 总结与建议

综上所述，便利店商品过期罚店员是不合法的。便利店应当建立并完善安全操作规程和相应制度，确保商品在保质期内销售，并由企业自行承担商品过期的风险。对于店员，便利店可以进行合理的内部处罚，但不能强行要求其为过期产品承担经济赔偿责任。

我建议便利店管理层应重新审视其管理制度，确保合规性，并加强对店员的培训和教育，共同维护食品安全和消费者权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。