竣工验收后发现部分工程未按图施工，一般不可以直接扣减工程款。具体分析如下：

1. 合同履行与违约责任：

   • 建设工程合同是双方意思表示一致的产物，双方应严格按照合同约定履行各自的义务。
   • 如果施工方未按图纸施工，可能构成违约，但违约责任的承担方式并非直接扣减工程款，而是应依据合同中的违约条款或相关法律规定来处理。

2. 工程质量与验收：

   • 竣工验收是对工程质量的全面检查，如果验收时发现部分工程未按图施工，应首先评估这部分工程是否符合质量要求。
   • 如果工程质量合格，只是与图纸不符，那么扣减工程款可能并不合适，因为施工方已经完成了合同约定的工程任务，只是实现方式有所不同。

3. 解决方案：

   • 双方可以协商解决，比如通过补充协议来明确未按图施工部分的工程价款调整方式。
   • 如果协商不成，可以通过诉讼或仲裁等法律途径来解决争议。在这个过程中，法院或仲裁机构会根据合同内容、双方过错程度以及实际损失等因素来综合判断。

4. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国民法典》等相关法律规定，合同双方应诚信履行各自义务，违约方应承担相应的违约责任。
   • 但具体责任承担方式需根据合同内容和实际情况来确定，并非直接扣减工程款。

综上所述，竣工验收后发现部分工程未按图施工，并不能直接作为扣减工程款的依据。双方应首先进行协商，并根据合同内容和实际情况来确定合理的解决方案。如果你在这方面有进一步的法律问题或需要更详细的法律建议，可以直接向我咨询。