协商解除劳动关系后，用人单位未支付经济补偿金，劳动者不可以向法院主张违法解除劳动合同。下面我来详细解释这个问题：
协商解除与违法解除的区别：
- 协商解除劳动合同，是指用人单位与劳动者在平等自愿的基础上，就劳动合同解除的相关事宜达成一致，并签订协议来解除劳动关系。
- 违法解除劳动合同，则是指用人单位在没有任何法定事由或未经法定程序的情况下，单方面解除与劳动者的劳动合同。
经济补偿金的支付：
- 在协商解除劳动合同的情况下，如果双方约定了经济补偿金，并且这一约定不违反法律法规的强制性规定，那么用人单位应当按照约定支付经济补偿金。
- 如果用人单位未按照约定支付经济补偿金，那么劳动者可以依据双方的协议，通过仲裁或诉讼等方式来要求用人单位履行支付义务。
为何不能主张违法解除：
- 因为协商解除劳动合同是双方自愿达成的一致意见，不存在违法解除的问题。即使用人单位未支付经济补偿金，也只是违反了双方的协议约定，而不是违反了劳动法的相关规定。
- 因此，劳动者不能因用人单位未支付经济补偿金而向法院主张违法解除劳动合同。
劳动者的救济途径：
- 如果用人单位未支付经济补偿金，劳动者可以向当地的劳动争议仲裁委员会申请仲裁，要求用人单位支付约定的经济补偿金。
- 如果仲裁裁决支持劳动者的请求，但用人单位仍不支付，劳动者可以向法院申请强制执行。
综上所述，协商解除劳动关系后用人单位未支付经济补偿金，劳动者应当通过仲裁或诉讼等方式来要求用人单位履行支付义务，而不能向法院主张违法解除劳动合同。