员工离职申请复印件通常代表员工主动辞职，但并非绝对。
一般情况：通常情况下，员工填写离职申请并被认定为是其真实意愿的表达，会被视为员工主动辞职。这是因为离职申请是劳动者向单位明确表达解除劳动合同意愿的主动行为，提交申请即意味着自愿结束与单位的劳动关系。
特殊情况：然而，如果存在证据证明填写离职申请并非员工的真实意愿，比如员工是在受到胁迫、欺诈等情况下填写的，那么这份离职申请就可以被主张为无效。在这种情况下，员工需要积极收集相关证据，如聊天记录、录音等，以证明自己的离职并非出于自愿，并向劳动仲裁机构或法院主张自己的权益。
因此，虽然员工离职申请复印件在大多数情况下代表员工主动辞职，但也需要考虑特殊情况的存在。如果员工认为自己的离职并非出于自愿，而是受到了不公正待遇，应该及时寻求法律援助，维护自己的合法权益。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。