员工发生交通事故后，工资的发放方式主要依据事故的性质以及员工是否构成工伤来确定。以下是对不同情况下工资发放方式的详细解答：
一、构成工伤的情况
上下班途中发生交通事故：
- 如果员工在上下班途中发生交通事故，且不负主要责任，根据《工伤保险条例》，这应被认定为工伤。
- 在此期间，用人单位需按照员工的原工资福利待遇支付工资，即停工留薪期工资。
- 停工留薪期一般不超过12个月，伤情严重或情况特殊可适当延长，但延长不得超过12个月。
工作过程中发生交通事故：
- 如果员工在工作过程中因交通事故受伤，并且这被认定为工伤，那么员工同样享受停工留薪期的待遇。
- 工资发放责任由用人单位承担，按照原工资福利待遇按月支付。
二、不构成工伤的情况
员工负主要责任：
- 如果交通事故责任主要在员工，且不属于工伤情形，那么在员工因伤无法正常工作期间，用人单位可按照劳动合同约定及规章制度支付病假工资。
- 病假工资的标准各地规定不同，但通常不低于当地最低工资标准的一定比例（如80%）。
特别约定：
- 若员工与用人单位之间有关于此类情况工资支付的特别约定，且该约定不违反法律法规的强制性规定，那么应按照约定执行。
三、注意事项
- 工伤认定：对于是否构成工伤，需要由相关部门进行认定。因此，在事故发生后，员工应及时向用人单位报告，并由用人单位或员工本人向相关部门申请工伤认定。
- 病假工资与最低工资标准：在支付病假工资时，用人单位应确保支付的工资不低于当地最低工资标准的一定比例。
- 法律维权：如果用人单位未按规定支付工资或拒绝支付工伤赔偿，员工可以通过法律途径维权，如向劳动行政部门投诉或申请劳动仲裁。
综上所述，员工发生交通事故后工资的发放方式需根据具体情况来确定。如果构成工伤，用人单位需按照原工资福利待遇支付停工留薪期工资；如果不构成工伤，则按照劳动合同约定及规章制度支付病假工资。在任何情况下，用人单位都应确保支付的工资不低于当地最低工资标准的一定比例。