新要求员工办理健康证是合法的，且是必要的。健康证是公共场所从业人员，尤其是直接为顾客服务的人员的“标配”。办理健康证的主要目的是为了预防痢疾、伤寒、病毒性肝炎、活动性肺结核等传染性疾病的传播，从而保障人民群众的健康权益。

根据《公共场所卫生管理条例实施细则》的规定，公共场所经营者应当组织从业人员每年进行健康检查，从业人员在取得有效健康合格证明后方可上岗。如果用人单位安排未获得有效健康合格证明的从业人员从事直接为顾客服务工作，将面临卫生计生行政部门的处罚，包括警告和罚款等。

至于健康证的办理流程，通常是由用人单位负责统计本单位需预防性体检从业人员名单，并向属地体检机构提出预约申请。体检机构会按照用人单位提交的预约申请名单提供《体检表》。完成体检并合格后，从业人员就可以获得健康证。在某些地区，为了方便群众，还推出了线上预约和下载健康证的服务。

因此，新要求员工办理健康证不仅合法，而且是遵守相关法规、保障公共卫生安全的重要举措。建议贵公司按照相关规定，积极组织员工办理健康证，确保员工的健康状况符合从业要求。