如果下班途中遇车祸且肇事者失踪，保险公司会按照你购买的保险类型和保险条款进行赔偿。具体来说：

1. 交强险赔偿：

   • 交强险是车辆必须购买的保险，用于赔偿交通事故中受害人的损失。如果肇事车辆购买了交强险，即使肇事者失踪，受害人也可以向肇事车辆的保险公司申请交强险赔偿。
   • 交强险的赔偿范围包括医疗费、误工费、护理费、残疾赔偿金、死亡赔偿金等，但具体赔偿金额和项目会根据保险条款和实际情况有所不同。

2. 商业险赔偿：

   • 如果你自己购买了商业险（如车险、人身意外险等），并且保险条款中包含了相关赔偿项目，那么你也可以向自己的保险公司申请赔偿。
   • 商业险的赔偿范围和金额会根据你购买的保险类型和保险条款来确定。例如，如果你购买了车险中的“车上人员责任险”，那么你在车祸中受伤时，保险公司会按照条款约定进行赔偿。

3. 寻找肇事者和报警：

   • 尽管肇事者失踪，但你还是应该尽快报警，并提供尽可能多的事故信息和肇事者信息，以便警方能够展开调查并寻找肇事者。
   • 如果警方最终能够找到肇事者，那么你可以向肇事者或其保险公司主张更多的赔偿权利。

4. 咨询专业意见：

   • 在处理此类复杂的交通事故赔偿问题时，建议你咨询专业的律师或法律机构，以便更好地了解你的权益和赔偿途径。

总之，下班途中遇车祸且肇事者失踪时，你首先应该报警并寻求医疗救助，然后根据自己的保险情况向相关保险公司申请赔偿。如果有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。