病假两周是否影响年底绩效，并非由单一因素决定，而是取决于公司的具体规章制度以及劳动合同的约定。以下是对此问题的详细分析：
公司规章制度的规定：
- 多数公司在其规章制度中会明确规定员工病假、事假等假期对绩效考核的影响。若公司规章制度中明确规定了病假两周会影响年底绩效，那么按照公司规定执行。
- 规章制度可能还规定了病假期间的工资发放、绩效考核的具体标准等，这些都会直接影响到年底绩效的评定。
劳动合同的约定：
- 劳动合同是员工与公司之间权利与义务的重要约定。如果劳动合同中明确约定了病假对绩效的影响，那么应当遵循劳动合同的约定。
- 劳动合同中可能还包含了关于病假期间工资待遇、绩效考核方式等条款，这些也是判断病假是否影响年底绩效的重要依据。
实际情况的考量：
- 即便公司规章制度和劳动合同中没有明确规定病假两周会影响年底绩效，但在实际操作中，公司可能会根据员工的实际工作情况、病假期间的表现以及公司整体绩效情况等因素，对员工的年底绩效进行综合考虑。
- 如果员工在病假期间能够积极与公司保持沟通，确保工作交接顺畅，并在病假结束后迅速投入工作，那么病假对年底绩效的影响可能会相对较小。
综上所述，病假两周是否影响年底绩效，需要综合考虑公司的规章制度、劳动合同的约定以及实际情况等多个因素。建议你在查阅公司相关规章制度和劳动合同后，与公司人力资源部门或上级领导进行沟通，以明确病假对年底绩效的具体影响。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，可以直接向我咨询。