医院进修期间基本工资一般不会被扣除。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律依据

根据《中华人民共和国劳动法》第六十八条，用人单位应当建立职业培训制度，并按照国家规定提取和使用职业培训经费，有计划地对劳动者进行职业培训。进修作为职业培训的一种形式，是劳动者提升技能和知识的重要途径，因此，用人单位通常不会因此扣除劳动者的基本工资。

二. 工资支付原则

1. 按时足额支付：根据《中华人民共和国劳动法》第五十条，工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人，不得克扣或者无故拖欠。这意味着，在劳动者参加进修期间，只要其仍然履行与原用人单位的劳动合同，用人单位就应当按照约定支付基本工资。

2. 合同约定优先：如果劳动者与用人单位在劳动合同或相关协议中明确约定了进修期间的工资待遇，双方应当按照合同约定执行。在没有明确约定的情况下，用人单位应当按照法律规定和单位政策支付工资。

三. 医院政策与实践

1. 政策差异：不同医院对于进修期间的工资待遇可能有不同的政策。一些医院可能会明确规定进修期间工资、津补贴、医院相关绩效照发，科室绩效按本科室同级别在岗职工平均绩效的一定比例发放。而另一些医院则可能根据进修的具体情况和医院的财务状况来灵活决定工资待遇。

2. 实践案例：以中南大学湘雅二医院为例，其规定进修期间工资、津补贴、医院相关绩效照发，科室绩效按本科室同级别在岗职工平均绩效的100%发放。同时，学费和培训费凭发票或财政票据全额报销，学习期间的伙食补助费、交通补助费及往返车船费也按有关规定办理。

四. 特殊情况

如果进修是劳动者自愿参加的，而非用人单位安排的，且进修期间劳动者无法履行原劳动合同中的工作职责，那么用人单位可能会根据实际情况来决定是否支付基本工资。但即便如此，用人单位也不得违反法律规定克扣或无故拖欠劳动者的工资。

我的观点：医院进修期间基本工资一般不会被扣除，但具体待遇还需根据医院的规定和劳动合同或相关协议的约定来确定。建议劳动者在进修前与医院沟通明确工资待遇问题，并查阅相关法律法规和劳动合同以维护自己的合法权益。如有进一步需要，您可以继续咨询我。