企业要求入职人员检查乙肝，除特殊工作外，通常是不合法的。以下是具体的法律分析：
一. 入职体检查乙肝的合法性分析
一般规定：根据相关法律法规，除国家法律、行政法规和卫生部规定禁止从事的易使乙肝扩散的工作外，用人单位不得强制要求入职人员检查乙肝项目，也不得以劳动者携带乙肝表面抗原为理由拒绝招用或者辞退乙肝表面抗原携带者。这是因为，乙肝并不属于影响一般工作能力的疾病，且强制检查可能涉及对劳动者的健康歧视。
特殊工作除外：然而，对于某些特殊工作，如食品处理、医疗卫生等，由于工作性质的特殊性，可能确实需要对乙肝等传染病进行特殊检查。但这种情况下，也必须有明确的法律法规依据，且用人单位应确保检查过程的合法性和公正性。
二. 企业要求入职检查乙肝的法律后果
违法风险：如果企业未经允许擅自要求入职人员检查乙肝，可能面临法律风险。一旦劳动者因此受到歧视或权益受损，企业可能需要承担相应的法律责任，包括支付赔偿金等。
赔偿责任：根据《劳动合同法》第八十七条的规定，如果企业违法辞退患有乙肝的劳动者，应依法向员工支付赔偿金。赔偿金的计算标准为该员工在企业工作年限的月工资的两倍。
综上所述，我建议企业除非有明确的法律法规依据，否则应避免要求入职人员检查乙肝项目。这样做不仅符合法律法规的要求，也有助于营造公平、公正的就业环境。如有进一步需要，您可以继续咨询我。