公司合并时，员工是否会有补偿，这并非一个绝对的答案，而是需要根据具体情况来判断。以下是几种可能的情况及其对应的法律解释：
合同继续有效，无补偿：
- 根据《劳动合同法》的规定，公司合并时，原劳动合同继续有效，由合并后存续或新设的公司继续履行。如果合并后工作岗位、工作地点、劳动报酬等实质性内容未发生变化，只是公司主体发生变更，那么员工一般不会有补偿，劳动合同继续有效。
合同无法履行，有补偿：
- 如果因公司合并导致劳动合同无法继续履行，且经双方协商未能就变更劳动合同达成一致的，用人单位需要按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。经济补偿按劳动者在本单位工作的年限，以每满一年支付一个月工资的标准向劳动者支付。六个月以上不满一年的，按一年计算；不满六个月的，向劳动者支付半个月工资的经济补偿。
特定情形下的补偿：
- 若合并后公司以客观情况发生重大变化为由与员工解除劳动合同，且双方未就变更合同达成一致，或者公司因合并裁员，同样需要支付经济补偿。补偿标准同上。
违法解除或终止劳动合同的赔偿：
- 如果用人单位违反法律规定解除或者终止劳动合同，也需要按照经济补偿标准的二倍向劳动者支付赔偿金。
综上所述，公司合并时员工是否有补偿，取决于合并后劳动合同是否能继续履行以及是否存在特定情形或违法行为。如果员工面临公司合并的情况，建议首先与公司协商，了解合并后的具体安排和劳动合同的变化情况。如果协商不成或认为自身权益受到侵害，可以及时咨询律师，通过法律途径维护自己的合法权益。