总包给政府交“两金”是合法的。这里的“两金”通常指的是农民工工资应急周转金和农民工工资保证金，这两项制度的设立是为了保障农民工的合法权益，确保他们能按时收到工资，避免因拖欠工资而引发社会问题。

1. 农民工工资应急周转金制度：这是政府为了垫付解决因用人单位拖欠农民工工资造成生活困难，并有可能引发群体性突发事件而设立的应急专项资金。这笔资金由政府纳入年度预算，并专账核算管理、专款专用。

2. 农民工工资保证金制度：在工程建设领域中，施工总承包单位（总包单位）需要在银行设立农民工工资保证金账户，按照工程施工合同额的一定比例存储资金，作为专门用于支付所承建工程拖欠农民工工资的专项资金。

这两项制度的实施，既体现了政府对农民工权益的重视，也符合相关法律法规的要求。因此，总包单位按照规定向政府交纳“两金”是合法的，也是其应尽的社会责任。

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