针对您提出的问题“车辆卖给别人1000元钱，二手车发票开1000元是否合法”，需要从多个维度来进行分析。

首先，从法律的角度来看，开具发票应当遵循真实、合法、有效的原则，并如实反映交易的真实情况。如果车辆的实际销售价格确实是1000元，并且这一价格在市场上是合理的（考虑到车辆的状况、使用年限、市场价值等因素），那么开具1000元的二手车发票是合法的。然而，如果车辆的实际价值明显高于1000元，但为了避税或其他目的而故意低开发票金额，这种行为则是不合法的。

其次，从税务的角度来看，二手车交易涉及增值税等税费的缴纳。税务部门通常会根据发票金额来计算应缴纳的税费。如果发票金额明显低于实际交易金额，税务部门有权依据相关法律规定对销售额进行核定，并据此征收税费。此外，如果企业或个人存在偷税、漏税等违法行为，还将面临补税、滞纳金以及罚款等处罚。

在实际操作中，二手车发票的开具应当遵循相关法律法规和税务规定。如果车辆的实际销售价格与发票金额不一致，或者发票金额明显低于市场价值，不仅可能面临税务部门的稽查和处罚，还可能影响买卖双方的合法权益。例如，在车辆出现质量问题或发生纠纷时，低开发票可能导致买方难以维权。

综上所述，车辆卖给别人1000元钱并开具1000元的二手车发票是否合法，取决于车辆的实际价值以及交易的真实性。建议在进行二手车交易时，双方应如实申报交易价格并开具相应金额的发票，以确保交易的合法性和有效性。同时，也建议咨询当地税务部门或专业律师以获取更具体的法律意见和税务指导。