买二手车支付十二万但只开具五万金额的二手车销售统一发票是不合法的。

一. 发票开具应与实际交易金额相符

1. 根据《中华人民共和国发票管理办法》第二十二条的规定：“开具发票应当按照规定的时限、顺序、栏目，全部联次一次性如实开具，并加盖发票专用章”。这意味着发票上开具的金额应当与实际交易的金额完全一致。
2. 在本题中，买家支付了十二万，但卖家只开具了五万金额的发票，这显然违反了发票管理办法的规定，未如实开具发票。

二. 可能涉及的法律风险

1. 对于买家而言，如果发票金额与实际支付金额不符，可能会在后续的车辆过户、保险理赔等环节遇到麻烦，因为相关部门可能会依据发票金额来认定车辆的价值。
2. 对于卖家而言，这种行为可能构成偷税漏税，因为发票金额是税务部门计算税额的重要依据。如果发票金额低于实际交易金额，那么卖家可能会因此少交税款，从而面临税务部门的处罚。

三. 建议与解决方案

1. 我建议买家应要求卖家按照实际交易金额重新开具发票，以确保自身的合法权益不受损害。
2. 如果卖家拒绝重新开具发票，买家可以向当地的税务部门或市场监管部门进行举报，以维护自己的合法权益。

综上所述，买二手车支付十二万但只开具五万金额的二手车销售统一发票是不合法的，买家应要求卖家按照实际交易金额重新开具发票，并在必要时向相关部门进行举报。如有进一步需要，您可以继续咨询我。