结论前置：

1. 若存在故意低开发票金额以偷逃税费的情形，则属于违法行为。
2. 若因合理原因（如促销优惠、实际支付金额低于标价等）导致发票金额低于购车价，且依法纳税，则不违法。

详细分析：

1. 故意低开发票以偷逃税费：

   • 法律性质：根据《中华人民共和国税收征收管理法》第六十三条，纳税人伪造、变造、隐匿、擅自销毁帐簿、记帐凭证，或者在帐簿上多列支出或者不列、少列收入，或者经税务机关通知申报而拒不申报或者进行虚假的纳税申报，不缴或者少缴应纳税款的，是偷税行为。
   • 具体情形：若购车时实际支付16万元，但发票仅开具13万元，且卖方未就剩余3万元申报纳税，则构成偷税。此行为不仅卖方可能面临税务处罚（如补缴税款、滞纳金及罚款），若买方知情并参与，也可能承担相应法律责任。
   • 法律后果：税务机关可追缴税款、滞纳金，并处不缴或少缴税款百分之五十以上五倍以下的罚款；构成犯罪的，依法追究刑事责任。

2. 因合理原因导致发票金额低于购车价：

   • 法律性质：若发票金额低于购车价系因促销优惠、实际支付金额低于标价等合理原因，且卖方已就全部收入依法申报纳税，则不构成违法。
   • 具体情形：例如，购车时标价16万元，但因促销活动实际支付13万元，卖方按13万元开具发票并依法纳税，此行为合法。
   • 注意事项：买方应保留购车合同、付款凭证等证据，以证明发票金额与实际支付金额的一致性，避免后续纠纷。

建议：

• 购车时，务必要求卖方按实际交易金额开具发票，并核实发票内容与购车合同、付款凭证的一致性。
• 若发现卖方存在低开发票等违法行为，可向税务机关举报，维护自身合法权益及国家税收秩序。

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