结论前置：公司员工请假被扣钱，回来后还得补齐请假期间落下的工作，这一做法的合法性需根据具体情况分析。若公司规章制度或劳动合同中有明确规定，且该规定不违反法律法规，则此做法可能合法；若缺乏相关规定或规定违法，则此做法不合法。

详细分析：

1. 公司规章制度与劳动合同：

   • 若公司在规章制度或劳动合同中明确规定了员工请假需扣钱，并且需补齐请假期间的工作，那么这一做法在公司内部是具有约束力的。但前提是，这些规定必须合法，不能违反国家法律法规，如《劳动法》、《劳动合同法》等。
   • 若规章制度或劳动合同中无此规定，或规定本身违法（如扣款金额超过法定标准、要求员工超负荷工作等），则公司不能单方面要求员工补齐请假期间的工作或扣款。

2. 法律法规的约束：

   • 根据《劳动法》和《劳动合同法》，员工享有休息休假的权利，公司不能无故剥夺或限制。同时，对于员工的扣款，也需遵循相关法律法规的规定，不能随意扣减员工工资。
   • 若公司强制要求员工补齐请假期间的工作，且该要求超出了法律法规的界限（如要求员工加班但未支付加班费、工作强度过大等），则员工有权拒绝，并可向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁。

3. 员工权益保护：

   • 员工在面对公司不合理要求时，应首先查看公司规章制度和劳动合同中的相关规定，了解自己的权益和义务。
   • 若认为公司做法不合法或不合理，员工有权与公司协商、向劳动监察部门投诉或寻求法律援助。

总结与建议：

• 员工在请假被扣钱且被要求补齐请假期间落下的工作时，应先了解公司规章制度和劳动合同中的相关规定，判断其合法性。
• 若认为公司做法不合法，员工可与公司沟通协商，要求公司纠正；若协商无果，可向劳动监察部门投诉或提起劳动仲裁维护自己的权益。
• 公司在制定规章制度和劳动合同时，应确保内容合法、合理，尊重员工的权益和休息休假的权利。