二次请假公司扣钱是否合法，需要根据具体情况来判断。以下是对这一问题的详细分析：
一般情况下的请假扣钱：
- 用人单位不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。如果劳动者请假（如事假）且用人单位有相关规定或双方有约定，在请假期间不支付工资是合理的，但这并不等同于克扣工资。克扣工资是指无故减少劳动者的应得工资，而请假不支付工资是基于双方约定或公司规定，在特定期间（如事假期间）不支付工资。
- 对于年休假、探亲假、婚假等假期，用人单位应按劳动合同规定的标准支付劳动者工资，这些假期期间扣钱是不合法的。
二次请假扣钱的合法性：
- 如果公司规章制度或劳动合同中明确规定了二次请假需要扣钱，并且这一规定不违反法律法规的强制性规定，那么公司在二次请假时扣钱可能是合法的。
- 但如果公司没有相关规定，或者规定本身违法（如违反了不得克扣工资的原则），那么公司在二次请假时扣钱就是不合法的。
建议：
- 劳动者在请假前应仔细查阅公司的规章制度或劳动合同，了解请假期间工资支付的相关规定。
- 如果认为公司扣钱行为不合法，可以与公司进行沟通协商，要求公司解释扣钱的原因和依据。
- 如果沟通无果，劳动者可以向当地劳动监察部门投诉，或者通过劳动仲裁、诉讼等方式维护自己的合法权益。
综上所述，二次请假公司扣钱是否合法取决于公司的规定以及这些规定是否合法。劳动者在面临此类问题时，应了解自己的权益和公司的规定，并据此采取相应的行动。