即使公司发出了单方面解除劳动合同的通知书并且补偿金已经到位，你仍然有权申请劳动仲裁。以下是详细的分析：

1. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国劳动合同法》的相关规定，用人单位在特定情形下解除劳动合同需要向劳动者支付经济补偿。然而，支付经济补偿并不免除用人单位可能因违法解除劳动合同而应承担的法律责任。
   • 如果公司单方面解除劳动合同的行为违反了《劳动合同法》的规定，例如没有合法的解除理由、未提前通知或未支付足够的经济补偿等，那么劳动者就有权向劳动争议仲裁委员会申请仲裁，维护自己的合法权益。

2. 仲裁的适用性：

   • 劳动仲裁是解决劳动争议的一种法定方式，适用于用人单位与劳动者之间因劳动关系的建立、履行、变更、解除或终止等发生的争议。
   • 无论公司是否已经支付了经济补偿，只要劳动者认为公司的解除行为违法或侵犯了自己的合法权益，都可以申请劳动仲裁。

3. 申请仲裁的注意事项：

   • 在申请仲裁前，建议劳动者先与公司进行协商，尝试通过和解的方式解决争议。
   • 如果协商无果，劳动者应准备好相关证据，如劳动合同、解除通知书、工资单、社保记录等，以证明自己的主张。
   • 劳动者应在法定的仲裁时效期内向劳动争议仲裁委员会提出仲裁申请，以免错过维权的机会。

综上所述，即使公司发出了单方面解除劳动合同的通知书并且补偿金已经到位，如果你认为公司的解除行为违法或侵犯了你的合法权益，你仍然有权申请劳动仲裁。在申请仲裁前，建议你先与公司协商，并准备好相关证据以支持自己的主张。如果你有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。