农村自建房包工包料发生安全事故，一般由施工单位或承揽人承担主要责任，但定作人对定作、指示或选任有过错的，也应承担相应责任。具体分析如下：
一. 施工单位或承揽人的责任
- 施工单位的责任：根据《建设工程安全生产管理条例》第二十一条，施工单位主要负责人依法对本单位的安全生产工作全面负责，应建立健全安全生产责任制度，保证安全生产条件所需资金的投入，并进行定期和专项安全检查。若施工单位未能履行这些职责导致安全事故，施工单位应承担主要责任。
- 承揽人的责任：根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十三条，承揽人在完成工作过程中造成损害的，定作人不承担侵权责任。但此条款也指出，若定作人对定作、指示或选任有过错，则应承担相应责任。在包工包料的情况下，承揽人（即施工单位或个人）负责施工过程中的所有工作，因此若事故是由其施工不当或管理不善导致，承揽人应承担主要责任。
二. 定作人的责任
- 定作人的过错责任：同样根据《中华人民共和国民法典》第一千一百九十三条，若定作人在定作、指示或选任过程中存在过错，如选用了不具备施工资质的承揽人，或对施工过程中的安全指示不当，定作人也应承担相应的责任。
三. 连带责任
- 建设单位与施工单位的连带责任：根据《中华人民共和国民法典》第一千二百五十二条，若建筑物倒塌、塌陷造成损害，建设单位与施工单位应承担连带责任，除非它们能证明不存在质量缺陷。在农村自建房包工包料的情况下，若事故是由施工质量问题导致，建设单位（即房主）与施工单位可能需共同承担责任。
我建议，在发生农村自建房包工包料安全事故后，应首先查明事故原因，确定责任主体。若事故是由施工单位或承揽人的过错导致，应由其承担主要责任；若定作人也存在过错，则应承担相应责任。同时，若建筑物倒塌、塌陷造成损害，建设单位与施工单位可能需共同承担连带责任。如有进一步需要，您可以继续咨询我。